Die neue Liga setzt sich zum einen aus 44 Mannschaften aus der Qualifikation der einzelnen Regionalverbände zusammen. Darin enthalten sind vier Wildcards der Handball-Bundesliga für Vereine mit Jugendzertifikat. Die Wildcard kann mit Zustimmung der DHB-Jugend nach sportlicher Begründung in Anspruch genommen werden und geht zu Lasten des Kontingents des betroffenen Regionalverbands. Zum anderen qualifizieren sich vier weitere Mannschaften durch die Teilnahme am Final Four der Deutschen Jugendmeisterschaft. Die Staffeleinteilung erfolgt nach geographischen Gesichtspunkten, unabhängig von Verbandsstrukturen.
Die 44 Mannschaften der Regionalverbände setzen sich zusammen aus einer Sockelzahl von fünf Mannschaften pro Regionalverband, sowie anteilig der Mannschaftszahl der Jugend A und B. Die Plätze der Regionalverbände sind für drei Jahre festgeschrieben. Die Ligenleitung liegt bei der DHB-Jugend. Die HBL unterstützt die teilnehmenden Vereine mit finanziellen Zuschüssen.

Durch die Einführung der Jugend-Bundesliga sollen die Organisation der Leistungsligen im Bereich der Jugend A optimiert werden sowie gleiche Wettbewerbsbedingungen innerhalb des Hochleistungsbereichs der Jugend des DHB geschaffen werden, wobei auch den veränderten Bedingungen durch die Jugendarbeit der Bundesligavereine Rechung getragen wird.
Von: GC/CH